シングルセル解析システム
（遺伝子発現解析・カプセル化）

単一細胞のカプセル化 / 多様な細胞に対応するカスタマイズ可能
Nadia Innovateシリーズ　　

　Nadia Innnovateシリーズの動画

1) Nadia Innoveteシリーズ紹介

　Nadia Innnovateシリーズの特長

　Point 1　　シンプルな操作で1細胞をカプセル化

シングルセル解析では、対象細胞を1細胞に単離することが必要な作業となります。Nadia Innovateシリーズでは、流体力学技術を応用して均一なドロップレットの作成が可能で、簡単に1細胞をカプセル化できます。最も頻繁に使用されるscRNA-Seqにおいては、細胞懸濁液とビーズの懸濁液を2つの流路から流し、細胞とビーズが含まれるドロップレットを作成します。（下図）。Nadiaシリーズでは、Drop-Seq法を用いているため、細胞溶解が効率化され、遺伝子の検出率が高くなります。

ドロップレット形成の模式図

ドロップレット形成流路（左図）、Nadiaで作成されたドロップレット（右図）。

　Point 2　　カスタマイズ設定で多様な細胞に対応

従来の機器では、植物や非モデル細胞に対応することが難しかったのですが、Nadia Innovateでは、ドロップレットを作製時の各条件（圧力、温度、撹拌強度、時間）をカスタマイズし、多様な細胞でのカプセル化が可能となります。更に、開発したプロトコールはNadiaに転送して最大8サンプルまでの同時処理をすることで、スループットを高めることができます。

Nadia Innovatedeで調整可能なパラメーター
●送液圧力 (0~1000 mbar）
●温度（4℃~40℃）
●撹拌強度（0~300 rpm）
●各ステップの時間

Nadia Innovateセット

　Point 3　　NGS解析に最適化

NadiaシリーズのDrop-Seq/sNuc-Seqプロトコールでは、イルミナ社のシングルインデックスのペアエンドシークエンスに互換性のあるライブラリが調製されます。 Nextera XTインデックスキット（ #FC-131-1002）のN701 -N712 を使用してマルチプレックスが可能です。シークエンスには、次のプライマーを使用してください
Read 1: “Read1CustomSeqB” (5’ GCCTGTCCGCGGAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTAC)
Read 2: Standard Nextera P7 Sequencing Primer

Webinar: Analyse your single cell RNA Seq (YouTubeにリンク)

　論文紹介

論文紹介

Nadia Innovateシリーズを使用している文献情報を抜粋してお知らせします。

Modelling the impact of decidual senescence on embryo implantation in human endometrial assembloids. bioRxiv,Posted March 02, 2021.
Thomas M. et al. (2021).
使用細胞（目的）：Endometrial Stromal cells（scRNA-Seq）

Dissecting the Role of BET Bromodomain Proteins BRD2 and BRD4 in Human NK Cell Function. Front Immunol.,26 February 2021
Cribbs AP. et al. (2021).
使用細胞（目的）：NK cell（scRNA-Seq）

Highly accurate barcode and UMI error correction using dual nucleotide dimer blocks allows direct single-cell nanopore transcriptome sequencing. bioRxiv,Posted January 19, 2021.
Martin P. et al. (2021).
使用細胞（目的）：HEK293T and 3T3 cell（scRNA-Seq）

Single nucleus transcriptomics data integration recapitulatesthe major cell types in human liver. Hepatol Res. Feb;51(2):233-238.
Diamanti K. et al. (2021).
使用細胞（目的）：Liver tissue（Single Nucleous-Seq）

Discrete regulation of β-catenin-mediated transcription governs identity of intestinal epithelial stem cells. bioRxiv,Posted May 05, 2020.
Costanza B. et al. (2020).
使用細胞（目的）：Intestinal epithelial stem cell（scRNA-Seq）

Bulk and single-cell gene expression profiling of SARS-CoV-2 infected human cell lines identifies molecular targets for therapeutic intervention. bioRxiv,Posted May 05, 2020.
Wyler E. et al. (2020).
使用細胞（目的）：Vero E6, Calu-3 Calu-2 and H1299（scRNA-Seq）

Histone H3K27me3 demethylases regulate human Th17 cell development and effector functions by impacting on metabolism. Proc Natl Acad Sci USA. Mar 17;117(11).
Cribbs AP. et al. (2020).
使用細胞（目的）：T-cell（scRNA-Seq）

　製品リスト・仕様

(1) 機器リスト

品番	製品名	希望小売価格（税抜）
DB32005957	Nadia & Innovateセット	お問い合わせください
DB3200590	Nadia	お問い合わせください
DB3200595	Nadia Innovate（Nadiaと接続して使用）	お問い合わせください

※その他の消耗品、試薬につきましては、お問い合わせください。

(２) 製品仕様

Innovate

Nadia

製品番号

単独使用

新規プロトコール開発

ジャンクション部観察

撹拌機能

液滴サイズ

液滴体積

対応可能な細胞サイズ

細胞懸濁液量

ビーズ液量

オイル量

運転温度範囲

試料処理数

大きさ
（Innovateはセット）

重さ

電源

3200595

Nadiaと組み合わせて使用

可能

付属

有

64～96 μm(cv<5%)

137～463 pl

最大60 μm

100～250 ul

最大3 mL

4℃～40℃

1, 2, 4, 8

1,200 x 420 x 500 mm
(W × D × H)

10 kg(セットでは20 kg)

100 V　最大消費電力500 W

3200590

可能

不可

不要

―

有

80 μm(cv<5%)

268 pl

最大50 μm

100～250 ul

最大3 mL

4℃～40℃

1, 2, 4, 8

313 x 418 x 452 mm
(W × D × H)

20 kg

100 V　最大消費電力300 W

　改善されたDrop-Seq法

Nadia Innovateシリーズでは、より効果的なシングルセルRNAシーケンス（scRNA-Seq）プロトコルを開発しました。本プロトコールでは、下記の4点の特長があります。
１）高い補足率
２）低いタブレット率
３）低コスト
４）短期間
詳細はこちら※外部サイト（Dolomite Bio）にリンク